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阿里云智能達摩院-新冠肺炎全基因組測序智能分析

來(lái)源:人工智能產(chǎn)業(yè)發(fā)展聯(lián)盟     編輯:創(chuàng )澤   時(shí)間:2020/6/11   主題:其他 [加盟]

抗疫期間所解決的業(yè)務(wù)需求

快速準確的診斷新冠肺炎,并研究病毒基因組的演化,以便確定病毒的來(lái)源及傳播。

解決方案及特色

基因組檢測需要做到快速準確,對海量測序數據做到快速分析需要強大的計算和存儲系統。依托阿里云強大的云平臺,支持線(xiàn)上和本地化大數據套件部署。
基因組數據分析方面,主要提供并行、分布式的大數據分析系統。功能包括序列質(zhì)控、序列比對、序列拼接。每個(gè)步驟經(jīng)過(guò)優(yōu)化設計和參數調優(yōu)使得對于 CPU 和內存的利用更為高效,從而有效減少了數據分析的時(shí)間。此外,系統提供友好界面,并支持一鍵出分析報告功能。
除了病原體檢測之外,對于不同來(lái)源病原體的序列和結構分析有助于實(shí)現病原體的朔源和對應藥物分析。進(jìn)化分析以及基于深度學(xué)習的人工智能算法能夠加速并且精準實(shí)現預期目的。
系統采用云架構,支持線(xiàn)上和用戶(hù)本地部署。配合阿里云專(zhuān)有云的 Iaas 和 Paas 系統,快速搭建大數據平臺。該平臺采用分布式存儲和分布式計算系統,有效解決基因測序數據量大,分析計算需要分布式或并行方式的特點(diǎn);谠摯髷祿脚_,分析速度能有效提升 4~10 倍,人工智能分析處理速度也大幅提升。

應用與效果

全基因組測序技術(shù)在全國進(jìn)行應用實(shí)踐。阿里達摩院在浙江省疾控中心和武漢金銀潭醫院做試點(diǎn)應用,效果不錯,整體準確率非常高。

產(chǎn)學(xué)研結合情況及效果

在我們的實(shí)際應用中,該項技術(shù)整合了生物制藥企業(yè)、人工智能企業(yè)、醫療機構、高校等各方技術(shù)力量,從試劑研發(fā)、數據分析、流程設計等多角度全方位的設計來(lái)改進(jìn)和完善技術(shù)。





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開(kāi)發(fā)了告警接收、處置安排及消警反饋的移動(dòng)智能巡檢終端及其APP應用,融合人工智能、移動(dòng)應用的可視化遠程巡檢系統,實(shí)現隱患實(shí)時(shí)監測、智能分析、預警推送和快速處置的全流程閉環(huán)

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智慧識屏的出現解決了用戶(hù)的痛點(diǎn),為生活賦能,為產(chǎn)業(yè)助力,真正體現了人工智能技術(shù)的價(jià)值所在。
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